Twee ZonMW TOP subsidies voor genetisch onderzoek

Antoni van Leeuwenhoek ontvangt twee subsidies van ZonMW. Een subsidie voor onderzoek om bij hormoon-gerelateerde tumoren op zoek te gaan naar zogenoemde enhancer elementen die de activiteit van genen beïnvloeden. De andere subsidie is voor onderzoek naar hoe Big Data technieken kunnen worden ingezet om nieuwe biomarkers te vinden.
Kanker is een probleem van het DNA. Genetisch onderzoek is daarom van essentieel belang om kanker beter te kunnen begrijpen en aan te pakken. Zo kunnen genetische eigenschappen van tumoren gebruikt worden als 'biomarkers': je kunt het gebruiken voor de diagnose, en ook om te voorspellen hoe succesvol verschillende behandelingen zullen zijn.

Een probleem bij het zoeken naar biomarkers is dat moleculaire data veel informatie bevat. Bij de speurtocht naar nieuwe biomarkers moeten vele genetische gegevens van het liefst zo veel mogelijk patiënten worden geanalyseerd. Daarnaast kunnen allerlei andere gegevens, zoals die van proeven met tumoren in laboratoria, ook van belang zijn. Computationeel bioloog Lodewyk Wessels gaat in samenwerking met statisticus Mark van der Wiel, Marcel Reinders en Marco Loog  van de TU Delft nieuwe methodes ontwikkelen om met deze grote datasets om te gaan. Hierbij maken ze gebruik van technieken uit machine learning en statistiek. Met hun TOP subsidie gaan zij deze technieken inzetten om op zoek te gaan naar biomarkers die belangrijk zijn voor de vroege diagnose van orale kankers en baarmoederhalskanker. Ook gaat zij zoeken naar biomarkers die het succes van verschillende soorten behandelingen bij borstkanker en darmkanker voorspellen.

Omdat kanker niet alleen kan ontstaan doordat er een fout in bepaalde genen is geslopen, maar ook door fouten in de enhancer-gebieden die genen reguleren, zal het onderzoek erop gericht zijn om dit soort enhancers op te sporen bij twee hormonale typen kanker - hormonale borstkanker en prostaatkanker. De onderzoekers gaan kijken welke enhancers een cruciale rol spelen bij de tumorgroei en bij resistentie tegen behandeling. Op termijn moet dit leiden tot het verbeteren van de diagnose van de tumoren en tot nog nauwkeurigere behandeling op maat.
Gepubliceerd op:  17 maart 2017 495 x bekeken
Gerelateerde artikelen

Nederlands kankeronderzoek bundelt krachten: diagnostiek vrij-circulerend tumor-DNA naar kliniek

De analyse van spoortjes tumor-DNA in het bloed van kankerpatiënten is een nieuwe diagnostische techniek om te bepalen welke behandelingen individuele patiënten nodig hebben gedurende het verloop van hun ziekte. In Nederland worden nu alle krachten gebundeld om te onderzoeken – met studies voor long- en darmkanker – hoe de techniek ingebed kan worden en meerwaarde kan brengen in de ziekenhuispraktijk. Dit wordt gesubidieerd uit het onderzoeksprogramma Personalised Medicine van ZonMw.

20 november 2018197 x bekeken

Snel duidelijkheid over BRCA mutatie met nieuwe test

Onderzoekers van het Radboudumc hebben een nieuwe DNA-test ontwikkeld om vrouwen met eierstokkanker te onderzoeken op de aanwezigheid van BRCA-mutaties. Door te meten in het tumorweefsel spoort de test bijna twee keer zoveel BRCA-mutaties op dan de gangbare test in bloed. Zo kunnen patiënten sneller profiteren van een doelgerichte behandeling.

26 juni 2019239 x bekeken

Darmkankergen veroorzaakt ook borstkanker

Zeldzame mutaties in het NTHL1-gen, die eerder alleen in verband werden gebracht met darmkanker, kunnen ook borstkanker en andere soorten kanker veroorzaken. Dit nieuwe multi-tumorsyndroom is beschreven door onderzoekers van het Radboudumc, LUMC en het Prinses Máxima Centrum in Cancer Cell.

25 februari 2019149 x bekeken